Sự khác biệt giữa Gel xếp chồng và Gel tách

Sự khác biệt chính - Xếp chồng Gel và tách Gel
 

Các thuật ngữ xếp chồng gel và gel tách được sử dụng để giải thích kỹ thuật SDS-PAGE. Điện di gel SDS-PAGE hoặc natri dodecyl sulfate-polyacrylamide là một kỹ thuật phòng thí nghiệm được sử dụng để tách các phân tử protein dựa trên trọng lượng phân tử của chúng. Lý thuyết đằng sau kỹ thuật này là các protein có trọng lượng phân tử khác nhau cho thấy tỷ lệ di chuyển khác nhau; phân tử trọng lượng phân tử thấp di chuyển nhanh hơn trong khi phân tử trọng lượng phân tử cao di chuyển chậm. Phương tiện để di chuyển là một gel. Có hai loại gel có tên là gel xếp chồng và gel tách. Các sự khác biệt chính giữa gel xếp chồng và gel tách là Độ pH của gel xếp chồng là 6,8 trong khi độ pH của gel tách là 8,8.

NỘI DUNG

1. Tổng quan và sự khác biệt chính
2. Gel xếp chồng là gì
3. Gel tách là gì
4. Mối quan hệ giữa Gel xếp chồng và Gel tách
5. So sánh cạnh nhau - Xếp chồng Gel so với tách gel ở dạng bảng
6. Tóm tắt

Gel xếp chồng là gì?

Gel xếp chồng là một loại gel polyacrylamide đậm đặc thấp được đặt trên đỉnh của gel phân giải đậm đặc hơn (gel tách) trong kỹ thuật SDS-PAGE. Gel xếp chồng được sử dụng để cải thiện độ phân giải điện di. Độ phân giải tăng vì sự khác biệt giữa nồng độ gel xếp chồng và gel phân giải có ảnh hưởng đến protein trong mẫu. Vì nồng độ polyacrylamide trong gel xếp chồng thấp, kích thước lỗ chân lông cao hơn. Điều này cũng giúp tăng sự tách biệt.

Gel xếp chồng là một loại gel polyacrylamide lỏng lẻo với lỗ chân lông lớn khoảng 7% polyacrylamide. Những lỗ chân lông này không hoạt động như một rào cản đáng kể cho các phân tử protein lớn. Do đó gel này ảnh hưởng một chút đến khả năng di động của các protein. Điều này tạo ra sự phân tách theo tính di động và kích thước của protein bằng cách tập trung chúng vào giữa hai gel.

Hình 01: Gel Acrylamide SDS-PAGE

Độ pH của gel xếp chồng là 6,8. Độ pH của nó có tính axit hơn độ phân giải gel bằng 2 đơn vị pH. Độ pH này ngụ ý cường độ ion thấp hơn do đó điện trở cao hơn. Điều này kích thích tính di động của protein hơn các hạt tích điện khác có trong gel.

Gel tách là gì?

Gel tách hoặc gel phân giải của SDS-PAGEtechnique là một loại gel polyacrylamide đậm đặc được đặt trên đỉnh của gel xếp chồng cô đặc thấp. Gel tách chứa một lượng lớn polyacrylamide (10%). Độ pH của gel này được duy trì là pH = 8,8, đây là mức độ pH cao hơn so với gel xếp chồng.

Hình 02: Thiết bị điện di gel

Khi các phân tử protein đạt đến gel tách, sự di chuyển của các phân tử đó bị chậm lại vì gel tách là gel có nồng độ cao với kích thước lỗ nhỏ có thể đóng vai trò là rào cản đáng kể cho sự di chuyển của các phân tử protein. Sự chậm lại này cho phép các protein khác đang di chuyển chậm để bắt kịp, dẫn đến một dải hẹp, tập trung ở giữa hai gel.

Mối quan hệ giữa Gel xếp chồng và Gel tách?

• Cả hai loại Stacking Gel và Gel tách đều được sử dụng trong cùng một thiết bị.

Sự khác biệt giữa Gel xếp chồng và Gel tách?

Xếp chồng Gel và tách gel
Gel xếp chồng là một loại gel polyacrylamide đậm đặc thấp được đặt trên đỉnh của gel phân giải đậm đặc hơn (gel tách) trong kỹ thuật SDS-PAGE.	Gel tách hoặc gel phân giải của kỹ thuật SDS-PAGE là gel polyacrylamide đậm đặc được đặt trên đỉnh của gel xếp chồng đậm đặc thấp.
Vị trí
Gel xếp chồng được đặt trên gel phân giải (tách).	Gel tách được đặt dưới đáy của thùng chứa được sử dụng cho điện di gel.
Sự tập trung
Nồng độ của gel xếp chồng cao.	Nồng độ của gel tách thấp.
Nội dung polyacrylamide
Gel xếp chồng chứa khoảng 7% polyacrylamide.	Gel tách chứa khoảng 10% polyacrylamide.
pH
Độ pH của gel xếp chồng là 6,8.	Độ pH của gel tách là 8,8.
Kích thước lỗ chân lông
Kích thước lỗ lớn có mặt trong xếp chồng gel.	Kích thước lỗ nhỏ có mặt trong tách gel.
Nghị quyết
Stacking gel cho độ phân giải tốt hơn.	Gel tách cho độ phân giải kém.

Tóm lược - Xếp chồng Gel và tách Gel

Xếp chồng gel và gel tách là hai loại gel polyacrylamide được sử dụng để phân tách tốt hơn các phân tử protein trong một mẫu nhất định. Sự khác biệt giữa gel xếp chồng và gel tách là độ pH của gel xếp chồng là 6,8 trong khi độ pH của gel tách là 8,8.

Tài liệu tham khảo:

1. Điện di Gel Polyacrylamide. Điện di gel Polyacrylamide (Lý thuyết): Phòng thí nghiệm sinh học phân tử ảo II: Công nghệ sinh học và kỹ thuật y sinh: Phòng thí nghiệm ảo Amrita Vishwa Vidyapeetham. Có sẵn ở đây  
2. Cách thức hoạt động của SDS-PAGE. Bitesize Bio, ngày 16 tháng 2 năm 2018. Có sẵn tại đây
3. Gel xếp chồng SDS-PAGE - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew). Trang web Google. Có sẵn ở đây 

Hình ảnh lịch sự:

1.'SDS-PAGE Acrylamide gel'By Bensaccount tại Wikipedia tiếng Anh, (CC BY 3.0) qua Commons Wikimedia  
2.'Gel thiết bị điện di 'của Jeffrey M. Vinocur - Công việc riêng, (CC-BY 2.5) qua Commons Wikimedia